Построен как родовое гнездо династии крымских ханов Крым-Гиреев (Гераев). С 1532 по 1783 год был политическим и общественным центром Крымского ханства. Считается единственным в мире образцом крымскотатарской дворцовой архитектуры.
Именно об этом дворце идёт речь в поэме Пушкина "Бахчисарайский фонтан".
В годы советской власти во дворце был открыт музей, однако большевики постепенно свели его деятельность от этнографической к пропаганде марксизма.
При немцах музей работал, но был разграблен ими при отступлениии.
После депортации крымских татар дворец хотели снести, но памятник удалось отстоять, во многом благодаря тому факту, что ему посвящена поэма Пушкина.
В 1990 году музей был возрождён и действует и поныне.