Среди больших заслуг Николая Ивановича Пирогова, немалое место занимает его деятельность в области военной медицины. Военная медицина, в частности военно-полевая хирургия, обязана Н.И. Пирогову учением о медицинской сортировке раненых, о ранах и их лечении, о лечении огнестрельных переломов длинных трубчатых костей и суставов "сберегательным" методом.

Его метод сортировки раненых на фронте, позволял целесообразно и рационально использовать и без того дефицитные на войне руки санитаров и силы хирургов.

Раненых он разделял на четыре группы:

– смертельно раненые и безнадёжные, которым нужен лишь последний уход и предсмертные утешения
– раненые, требующие абсолютно неотложной хирургической помощи
– раненые, кому операция может быть отложена на следующий день или даже позднее
– легко раненые, состояние которых допускает возвращение в часть после простой перевязки.

Такая, казалось бы, простая сортировка должна была предотвратить беспорядок и неизбежный хаос, ибо, как говорил Пирогов: "Желая помогать всем разом и без всякого порядка перебегая от одного раненого к другому, врач теряет, наконец, голову, выбивается из сил и не помогает никому".

Также Пирогов первым изобрел и применил крахмальную, а затем гипсовую повязку при сложных переломах, заменив при этом ампутацию конечности более гуманной резекцией (частичное удаление).

Идея наложения гипса на переломы пришла в его голову в мастерской знакомого скульптора Николая Степанова. Наблюдая за работой художника, он заметил, как быстро твердеет гипс. Изобретение гипсовых повязок спасло жизнь и здоровье десятков тысяч людей. Поскольку в те времена фиксировать неподвижно сломанные кости не умели, очень часто конечности срастались неправильно, и человек оставался калекой на всю жизнь. А в самом плохом случае из-за нагноения приходилось ампутировать конечность. У Пирогова же количество подобных ампутаций было сведено к минимуму.