В первой части комплекса есть три главных храма — это храмы Вишну, Брахмы и Шивы. Все три храма являются символом Trimurti и были названы в соответствии с так называемой «Hindhu Trisakti» (древнеиндуистский религиозный трактат). Все они смотрят на восток и у каждого из них есть рядом маленький храм, который смотрит на запад.
Они предназначены для священных животных, на которых передвигались Боги. Согласно индуизму главные божества всегда имели своих собственных слуг-перевозчиков – божеств рангом пониже. Например, перевозчиком Ганеши, милого божества с головой слона, является мышь. Вспомогательные храмы комплекса Прамбанан были поделены между Гарудой – магическим орлом (перевозчик Бога Вишну), быком Нанди (транспортное средство Шивы) и лебедем (перевозчик Брахмы). Лебедь пользуется уважением в индийской культуре из-за его особого качества — способности отделять молоко из смеси молока и воды. Лебедь олицетворяет то, что все живые существа во Вселенной заслуживают справедливости, в каком бы положении они не оказались. Также, эта способность лебедя указывает на то, что индивид должен быть способен отделять хорошее от плохого, принимая то что имеет духовную ценность и отвергая то, что её не имеет.
При этом, вокруг Прамбанан находились ещё и храмы поменьше. И многочисленные миниатюрные священные сооружения занимали всё поле перед храмовым комплексом Прамбанан. К сожалению, большая часть из них не уцелела после землетрясения, оставив после себя лишь груды камней.