Музей работает ежедневно с 11:00 — 18:00, понедельник — выходной.
Музей интересен прежде всего тем, что находится в исторически интересном здании. Во время японского губернаторства — Карафуто (1905–1945 гг.) в административном центре г. Тоехара (ныне Южно-Сахалинск) для демонстрации коллекций по естественной истории острова японские власти построили здание музея в 1937 году на пожертвования населения. Здание музея губернаторства Карафуто выполнено в традиционном японском архитектурном стиле "тэйкан — дзукури" – "императорской короны". Сейчас именно в нем располагается Сахалинский областной краеведческий музей. Это одино из редчайших хорошо сохранившихся японских построек на Сахалине.
Возле музея имеется небольшой парк с фонтаном, работающим в летний период. В виду чего сюда приезжают фотографироваться свадьбы, гуляют мамаши с детьми и сидят парочки на скамеечках, вход на территорию свободный.
В музее хранится свыше 170 тысяч предметов и коллекций по природе, истории и культурному наследию народов Российской Федерации.К редким коллекциям относятся старинные предметы традиционной культуры сахалинских аборигенов: айнов, нивхов, уильта (ороков); амулеты, шаманские атрибуты XVII — начала XX вв.
Палеонтологические коллекции, такие как древнейшие останки китообразных, растений, моллюсков, живших в регионе нынешних островов десятки миллионов лет назад в палеозойской и мезозойской эрах, свидетельствуют об истории развития планеты Земля и населяющих её организмах.
В музее экспонируются подлинные документы, фотографии и предметы, свидетельствующие о сложной истории региона в ХIХ — ХХ вв.