Дворец Великого Магистра построен по проекту архитектора Джироламо Кассара в 1571 году для Великого магистра Мальтийского ордена вскоре после основания Валлетты. Завершал строительство итальянец Франческо Лапарелли. Дворец имел деревянные потолки, что было большой редкостью на Мальте. В 1724 году внутренние помещения были расписаны Николау Назони. Дворец служил резиденцией для 21 великого магистра, а сейчас здесь располагается канцелярия президента и мальтийский парламент.
Во дворце находится Оружейная палата, знакомящая с обширной коллекцией оружия и доспехов разных стран вплоть до XVIII в.