Всех приплывающих в Монастырскую бухту, первым, встречает далеко видный с Ладожского озера храм во имя Святителя Николая Мирликийского, в миру — святого Николая Чудотворца, покровителя плавающих и путешествующих, молитвами которого освящается водная стихия.


В 1853 году на средства петербургского купца Николая Солодовникова в Валаамском монастыре был построен каменный храм по проекту архитектора А.М. Горностаева. Первоначально, по замыслу архитектора, храм не был оштукатурен, глава обита железом, позолочена и покрыта лаком. Кресты были "вызолочены через огонь", а на небольшой колокольне находилось 9 медных колоколов.
.

Храм Святителя Николая 23 июля освятил игумен Дамаскин. По желанию ктитора в храме регулярно совершалась Божественная Литургия и постоянно читалась Псалтирь о живых и усопших благотворителях обители и их сродниках. Сейчас эта традиция восстановлена.


Архитектура храма вызвала восторг у французского писателя А. Дюма, посетившего Валаам в 1858 году. Он писал:
Эта церковь — подлинное сокровище, как по художественным достоинствам, так и по своему богатству — создание лучшего, на мой взгляд, архитектора России — Горностаева.


А.М. Горностаев (1808-1862) один из основоположников русского архитектурного стиля.
Наряду с К.А. Тоном, строителем храма Христа Спасителя в Москве, он стремился возродить утраченную со времён реформ Петра Великого национальную архитектурную традицию, ориентируясь на зодчество Древней Руси.
Прототипами Никольской церкви явились московские храмы XVI века. Храм имеет оригинальную композицию, рассчитанную на восприятие с просторов Ладоги.
Восьмерик по типу московских храмов XV-XVI веков увенчан шатром с золочёной луковичной главкой. Церковь имеет звонницу наподобие псковских, украшена массивными килевидными кокошниками.


Внешняя и внутренняя отделка храма носит на себе ясный отпечаток щедрости благотворителей и хорошего вкуса архитектора. Иконостас искусной резьбы, вызолоченный, с колоннами, с иконами XVII-XVIII-ХХ веков.


За левым клиросом обращает внимание на себя, храмовое изображение Святителя Николая в полном архиерейском облачении, в правой руке у него меч, а в левой — церковь.


Киот, в который поставлена икона — деревянная, искусно резная, вызолоченная, с крестом и балдахином. История иконы неизвестна, когда и кем создано это изображение и с какого времени оно находится в монастыре — неразгаданная тайна.
По монастырским описям 1825 года и по прежним старым описям икона украшала собою бывшую на острове часовню. Это изображение Святого Николая почиталось среди местных карел и паломников. Среди верующих оно считалось чудотворным.


В старинной монастырской рукописи зафиксирован один из многих чудесных случаев в часовне. Перед иконой стояла кружка для подаяний и местные жители приезжая помолиться опускали туда пожертвование на монастырь в виде мелких монет. Один из прихожан позарился на деньги и только протянул руку к кружке как на него грозно посмотрел Святой Николай. Вор от увиденного пришёл в оцепенение и не смог даже сдвинуться с места. Монахи с большим трудом отчитали его молитвой.

В 1856 году по проекту А.М. Горностаева для священнослужителей и братии на острове был построен двухэтажный каменный келейный корпус, украшенный поясами кирпичного орнамента.
В 1858 году на втором этаже игуменом Дамаскиным была освящена домовая церковь в честь святого Иоанна Дамаскина.
Иоанн Дамаскин — сирийский богослов и создатель церковных песнопений и молитв, живший в VII-начале VIII века в Дамаске, был небесным покровителем игумена Дамаскина.
..

Для создания красоты и уюта на каменистом острове, иноки привозили почву и, укрепив её подпорками, высадили клёны, ясени и сирень. Развели фруктовый сад и огород, огородив его от северных порывистых ветров сложенной из камней стеной. Посмотреть не удалось, весь путь паломников обозначен и ограничен лентой до входа в скит.


На юго-западной стороне острова установлен гранитный Поклонный Крест.
.
На нём изображены символические орудия Страстей Господних, а также изображение петуха, являющегося древним символом Воскресения и напоминающем о петухе, который троекратно возгласившем после отречения апостола Петра по предсказанию Спасителя.
У подножия — кости и череп первого человека Адама, традиционный символ в основании православного Распятия.
..

Рядом находится домик, очень живописно вписывающийся в пейзаж, в нём раньше была таможня монастыря. Монахи Никольского скита встречали путешественников, прибывших в монастырь, изымали здесь недозволенное спиртное, табак и оружие.


В 1998 году, после завершения реставрационных и восстановительных работ, храм был освящён Святейшим Патриархом Алексием II.

В скиту постоянно живут десять человек. Летом, когда к монахам присоединяются паломники, в Никольском храме совершается Божественная литургия и молебны, читается Неусыпаемая Псалтирь.
В зимнее время богослужения совершаются в домовом храме во имя прп. Иоанна Дамаскина.
..

В день памяти перенесения мощей Святителя Николая Чудотворца из Мир Ликийских в Бар, из монастыря совершается Крестный ход по водам с почитаемой иконой Святителя Николая в скит.
.

В дар обители в 2013 году был передан ковчег с частицей мощей Святителя Николая.
Игумен Валаамского монастыря епископ Троицкий Панкратий отметил:
Пребывание ковчега с мощами Святителя Николая Чудотворца, покровителя и заступника всем путешествующим, даст возможность каждому паломнику, посещающему Валаам, помолиться о своём заступничестве перед этой святыней.

На территории скита кроме каменного храма и келейного корпуса находится восстановленный в тихой заводи деревянный причал для малых судов, там стоит судно подаренное Патриарху РПЦ.


В 2010 году на острове Светлом, лежащем напротив Никольского скита, по проекту архитектора А.А. Анисимова, была построена часовня Валаамской иконы Божией Матери, которую освятил Святейший Патриарх Кирилл.

По словам Его Святейшества, часовня в честь Валаамской иконы и расположенный по другую сторону бухты Никольский скит словно образует Святые Врата на входе в Монастырскую гавань, от которой идёт путь к главной святыне Валаамского архипелага.