После успешного отражения 
Первого крестового похода против гуситов в 1420 году и провала Второго крестового похода против гуситов в 1422 году чешский народ, вставший на борьбу против королевской власти и католической церкви, впервые в истории средневековой Европы отверг наследственное право короля на престол и создал республиканское правление в масштабах целой страны. Казалось бы, угроза Третьего крестового похода должна была привести к сплочению всех сил гуситского движения против общего врага в лице короля Германии, Венгрии и Чехии Сигизмунда I и папы римского Мартина V. Однако разногласия между умеренными и радикальными гуситами не прекращались и все более обострялись, неотвратимо приближая разрыв между ними.
Умеренные гуситы именовались чашниками, по требованию причащаться обоими видами причастия, то есть хлебом и вином из чаши, а не только хлебом, как было установлено в католицизме. Социальную основу чашников составляли зажиточные городские бюргеры и домовладельцы, паны и дворяне, владевшие землей. Они требовали сохранения основных догматов католической церкви, но с упразднением привилегий и землевладений церкви, ограничения королевской власти с изгнанием из Чехии немецких феодалов и патрициев.
Радикальные гуситы именовались таборитами, по названию горы Табор в южной Богемии, на которой они основали военный укрепленный лагерь. Армия таборитов состояла из крестьян под командованием Яна Жижки, которую поддерживала пражская городская беднота под руководством Яна Желивского. Табориты призывали уничтожить частную собственность и верили, что грядет второе пришествие Иисуса Христа, который установит Царствие Божие: «Не будет на земле ни королей, ни властителей, ни подданных, исчезнут налоги, а правление будет передано в руки народа». Табориты ненавидели католическое духовенство и призывали к евангельской простоте, любви, равенству и братству.
В 1422 году крестьянская армия таборитов продолжала успешные военные действия на юге Чехии против одного из лидеров чашников — пана Ольдржиха из Рожмберка, правителя города Чески-Крумлов. Городское ополчение таборитов осадило замок Карлштейн — последний оплот короля Сигизмунда I вблизи Праги. Гарнизон замка упорно оборонялся, рассчитывая на укрепленные стены и скорую подмогу королевской армии. На сейме в Нюрнберге Сигизмунд I призвал немецких князей остановить распространения «богемского еретического яда», обещая им отдать во владение ту часть Чехии, какую рыцари сумеют захватить. Не желая нести бремя расходов на организацию нового крестового похода против гуситов, немецкие рыцари предложили собрать необходимые для вторжения средства путем введения особого налога, чему воспротивились немецкие города, не желавшие принимать на себя тяжесть расходов похода, всеми выгодами которого воспользовались бы только крестоносцы.
Удалось собрать лишь малое войско, которое занялось грабежами и убийствами в приграничных районам западной Чехии. Ян Жижка обратился с посланием к жителям захваченных земель: «Пусть каждый возьмет в руки дубину или камень против короля-антихриста и немецких рыцарей — губителей земли чешской. Повстанцы, отважно сражаясь, малый против большого, немногие против множества, невооруженные против вооруженных, сумеют добиться славных побед». Повсеместно встречая упорное сопротивление, крестоносцы сумели захватить небольшой приграничный город Тахов, но узнали, что осажденный гарнизон Карлштейна заключил перемирие с таборитами, и напуганные известием о приближении армии Жижки, отступили в Германию. Разграбление Тахова в 1422 году стало предвестником Третьего крестового похода против гуситов.
В этом же году в Праге происходит организованное чашниками убийство лидера пражских таборитов Яна Желивского, позднее не удается покушение на полководца таборитов Яна Жижку руками наемных убийц, подосланными чашниками. Начинается вооруженное противостояние между умеренными и радикальными гуситами, переросшее в гражданскую войну. В 1423 году пражские бюргеры-чашники начинают открытые военные действия осадой таборитской крепости Кржиженек. Безуспешные попытки взять крепость продолжались до тех пор, пока пражанам не пришлось спешно снять осаду, узнав о приближении таборитской армии Жижки. Воспользовавшись отступлением пражских чашников, табориты берут под контроль город Градец-Кралове.
4 августа 1423 года происходит первое в истории гуситских войн сражение между умеренными и радикальными гуситами, названное битвой при Страуховом дворе (bitva u Strauchova dvora) на западной окраине современного города Градец-Кралове. Мало того, что в битве чехи воевали против чехов, но и командовали противоборствующими сторонами два полководца, ранее являвшихся близкими друзьями: таборит Ян Жижка и чашник Дивиш Боржек, перешедший в умеренную партию и ставший из сторонников радикальных гуситов их противником.
Жижка был хорошо осведомлен о передвижении противника и решил встретиться с ним в открытом поле перед стенами города. Табориты построили круговое оборонительное передвижное укрепление из скрепленных цепями и защищенных щитами повозок. Чашники предприняли несколько попыток прорвать оборону таборитов, но потеряв 200 человек, отступили к Праге.
Жижка воспользовался стратегически выгодной ситуацией и занял город Часлав, где сформировал новый восточночешский союз четырех городов (Градец-Кралове, Часлав, Яромерж, Двур-Кралове-над-Лабем) с постоянно действующей армией таборитов из 500 всадников, 7000 пехотинцев и 300 повозок с бомбардами. В ответ умеренные гуситы созывают в Праге Свято-Гавельский сейм, на котором к чашникам присоединилось большое количество сторонников католической церкви из числа чешского дворянства. Сейм избрал правительство страны с равным представительством чашников и католиков, а также объявил таборитов врагами, при этом имя Яна Жижки в решениях сейма не называлось.
Весной 1424 года происходит ряд вооруженных столкновений между армиями Свято-Гавельской коалиции и восточночешского союза, при этом Жижка избегал открытого сражения с превосходящим противником. Наконец, 7 июня 1424 года в нескольких километрах от города Кутна-Гора происходит битва при Малешове (bitva u Malešova), самое кровопролитное сражение гражданской войны в Чехии гуситского периода. Ход битвы описан в «Старых чешских хрониках», собранных «отцом чешской историографии» Франтишеком Палацким: «Затем Жижка двинулся маршем на Малешов близ Кутна-Горы, и пражане все еще следовали за ним, вступив в союз с некоторыми панами, и хотели победить его. Жижка быстро отступил перед ними, чтобы найти подходящее место для боя. Он укрылся со своими повозками на холме, укрепился там и стал ждать пражан, которые погнались за ним и сказали, что он уже убегает от них. Они даже не стали дожидаться, пока все соберутся, а пошли через долину к холму, где их ждал Жижка. Он приготовился к битве: выстроил армию в линию, сначала всадники, затем пехотинцы. Затем он взял фуражные повозки, приказал наполнить их камнями, и поставил их позади всадников, чтобы враги их не увидели. Жижка дождался, когда половина войска пражан начнет подниматься на холм и послал против них своих всадников. Пехотинцы, находившиеся позади конницы, толкали груженные камнями повозки. И когда пражане приблизились, на них сверху обрушились тяжелые повозки и полностью сломали их ряды. Затем Жижка обстрелял их из пушек и приказал своим людям нанести по ним удар. Пражане обратились в бегство, сметая по дороге тех, кто следовал за ними, и так все они сбежали».
В битве при Малешове в очередной раз проявился военный гений таборитского полководца Яна Жижки: искусный выбор поля битвы с учетом природного ландшафта и решительное применение новой тактики против превосходящих сил противника. Разогнавшиеся по склону холма тяжелогруженые повозки смели передовые линии чашников, которые своим бегством внесли хаос в задние ряды армии, началась паника, усиленная кавалерийской атакой табаритов. В битве при Малешове погибло всего 200 воинов Яна Жижки, тогда как потери чашников составили 1400 солдат и 300 панов.
После битвы при Малешове Жижка повернул к городу Кутна-Гора и без сопротивления взял его. Вслед за этим перед таборитами открыли свои ворота 10 городов Свято-Гавельской коалиции, перейдя в восточночешский союз. Слепота и преклонный возраст не мешали Яну Жижке руководить продолжавшимися военными действиями. Неустрашимый, с железной волей, он был крайне жесток при расправе с врагами: из-за суровости, непреклонности, слепоты на оба глаза и умения побеждать врагов Жижка получил прозвище «Страшный слепец».
Таборитская армия форсированным маршем подошла к Праге и осадила город, намереваясь разрушить «этот современный Вавилон». Великий ужас овладел городом, не было войска, способного оказать сопротивление, и пражане решили просить пощады у Жижки, направив покаянное посольство. Делегацию возглавлял Ян Рокицана, гуситский богослов, избранный Свято-Гавельским сеймом архиепископом Праги, хотя папа римский и не признал этого избрания. Образованный, красноречивый и дипломатичный Ян Рокицана смог убедить Жижку отменить намеченный штурм Праги, и 14 сентября 1424 года было заключено перемирие между умеренными и радикальными гуситами.
Войско таборитов, объединившись с пражскими отрядами чашников, двинулось в Моравию, где 11 октября 1424 года Ян Жижка умер, по одним источникам от чумы, по другим – от заражения крови. Гражданская война на время прекратилась, дав возможность подготовиться к отражению Третьего крестового похода против гуситов.
