Алтай всегда находился на перекрестке цивилизаций, и каждая оставляла свой отпечаток на религиозно-культурных традициях коренного населения региона. Поэтому когда говорят о религии алтайцев, имеют в виду сложную смесь из элементов разных религий — от язычества до христианства.

Религиозные воззрения алтайцев зародились в глубокой древности. Первоначально религией алтайцев был шаманизм с выраженными чертами пантенизма, то есть обожествления природы. По представлениям алтайцев, видимый мир делится на три сферы: небесную, земную и подземную.

Владыка верхнего мира — Верховный бог-создатель — Ульгень. Подземным же миром правит его брат Эрлик. Земной мир населяют люди и огромное количество разных духов, которые людям ближе небесных богов. В первую очередь это, конечно, духи природы. По представлениям алтайцев, каждому природному объекту соответствует свой дух — ээзи. Ээзи населяют горы, источники, реки, ледники, перевалы и даже деревья, камни и т.д. Считается, что ээзи обычно невидимы, но иногда могут принимать облик человека или животного. Так, например, ээзи — хозяин Алтая часто предстает в образе женщины с рыжими волосами, а иногда показывается в образе старика в белой одежде. По представлениям алтайцев, хозяина Алтая можно увидеть во сне. Если он приснится, то это предвещает удачу. Через сон хозяин Алтая может высказать свое недовольство человеком или его наказать. Вообще, считается, что духи восприимчивы к людскому вниманию. Если не соблюдать уважения к духам, то можно их огорчить и привлечь неприятности и несчастья. Одним из наиболее распространенных обрядов, через который почитаются духи, является обряд завязывания ленточек на ветках так называемых шаман-деревьев, которые и сейчас часто встречаются на Алтае.

В конце 19 века на Алтай пришли православные миссионеры. Создавая благоприятные условия жизни для перешедших в христианство язычников, православная церковь быстро стала популярной среди алтайцев. Однако, алтайцы все равно хранили веру в языческих духов, по-прежнему обращались к шаманам.

В начале 20 века на Алтае началось создание обновленной религиозной идеологии — бурханизма. В основе бурханизма лежали элементы исторических мифов алтайского народа о пришествии спасителя — Белого Бурхана, который освободит свой народ от чужеземного ига. Вестником Бурхана должен выступать хан Ойрот — священная личность для всех тюркских народов. Бурханизм в противовес шаманизму получил название белой веры. Он отвергал курение, камлание и кровавые жертвоприношения, столь характерные для шаманского культа.