Строительство Нижегородской губернской тюрьмы на 226 камер началось весной 1910 года и завершилось осенью 1914 г. Первым начальником тюрьмы был штабс-капитан Цибульский Александр Васильевич. Губернская тюрьма состояла из главного корпуса, женского корпуса, двух административных корпусов, больницы, бани и прачечной. Имелось водоснабжение, канализация, паровая котельная.

В 1921 г. Нижегородская губернская тюрьма переименована в Первый Нижегородский исправительный трудовой дом. В дальнейшем тюрьма называлась в разные годы Нижегородским изолятором специального назначения и Нижегородской фабрично-заводской колонией, а с 6 января 1964 г. носит название следственный изолятор №1. Более 15 лет — с 1968 г. по 1984 г. — СИЗО №1 возглавлял полковник внутренней службы Морозов П. В., с 1984 г. по 1994 г. — полковник внутренней службы Бубликов А. Н., с 1994 г. — полковник внутренней службы Топанов С. А., с 2004 г. по 2012 г. — полковник внутренней службы Ларин В.Н. С марта 2012 года по настоящее время учреждением руководит полковник внутренней службы Иванов Константин Васильевич.

В учреждении за последнее время значительно улучшены условия содержания спецконтингента и условия несения службы личным составом: введен в эксплуатацию в 2000г. отдельно расположенный корпус для несовершеннолетних, смонтирована специальная система вентиляции воздуха в камерных помещениях, построено новое караульное помещение, караульный городок, шлюзовая камера, произведен ремонт общежития для сотрудников, установлена автоматизированная система охраны и компьютеризированная система учета спецконтингента.