Возвращаясь с охоты поздним вечером, герцогская свита заблудилась и чуть не сверзилась с отвесного утеса, к счастью вышла луна и герцог увидел внизу перед собой гладь прекрасного озера. Озеро назвали Лунным (Мондзее), а в честь спасения, герцог повелел заложить на берегу озера монастырь.

В этой легенде речь видимо идет о баварском герцоге Одилоне, зяте Карла Мартела, основателе нескольких бенедиктинских обителей. Так в 739 году он основал баварский Бенедиктенбоерн, монастырь св. Михаила и Петра на Мондзее был основан им в 748 году.

Первыми в этой обители поселились бенедиктинцы из Монте Кассино. В 788 году монастырь был выведен из подчинения Зальцбургу, стал имперским. Позднее он принадлежал Регенсбургской епархии, а после распада Священной Римской Империи в 1512 году был передан Австрии.

В 1791 году монастырь был секуляризировал, монастырская церковь св. Михаила стала приходской. Сейчас в монастырском здании, так называемом дворце Мондзее, находится отель. Церковь является действиующей и поныне, в 2005 году Папа Иоан Павел II присвоил ей титул Базилики минор.

Каменное романское здание базилики существовало на этом месте с 11 до середины 15 века. Готический собор был освящен в 1487 году, в 17-18 веках в отделку были внесены элементы барокко. Колокольни и обновленный фасад были созданы в 1730 году по эскизам Ёзефа Мунггенаста и Антонио Салла.

Центральный алтарь создан Хансом Вальдбургером в 1626 году. Главное украшение собора — алтари Майнрада Гуггенбихлера (1649 -1723).