Кош-Агач находится в 438 км от города Горно-Алтайск на федеральной автомобильной дороге М52 «Чуйский тракт». Дорога от Кош-Агача до Горно-Алтайска асфальтированная и хорошего качества.
Чуйским трактом исторически считается трасса от Бийска до границы с Монголией. В давние времена здесь находился так называемый Мунгальский тракт, упоминания о котором содержатся ещё в китайских хрониках тысячелетней давности.
Дорога по Чуйскому тракту очень живописна, красивейшие места меняются с невообразимой быстротой. От Кош-Агача сначала трасса идёт вдоль реки Чуи, затем петляет вдоль берега Катуни. Дорога пересекает перевалы Чике-Таман, Семинский и другие. Горный рельеф постепенно сменяется предгорным.