В XX веке коллекция зоопарка активно пополнялась — в частности, за счёт даров из других стран — и к середине столетия стала одной из богатейших в Европе. Благополучие несколько пошатнулось с окончанием Португальской колониальной войны и обретением колониями независимости в 1975 году, после которого зоопарк лишился важных «поставщиков». Ещё один кризис, на этот раз связанный с финансированием, случился в конце 1990-х годов. Чтобы привлечь внимание к этой проблеме, директор зоосада пошёл на крайние меры: он отправился на заседание парламента, взяв с собой льва и тигра. С тех пор положение зоопарка значительно улучшилось.