Это один из немногих храмов, который за полтора века никогда не закрывался — ни в годы гонений на церковь, ни в годы войны, ни в разгул послевоенного атеизма. И выстоял он благодаря мужеству прихожан. Местные казаки устраивали дежурства, днём и ночью охраняя его от посягательств.

В феврале 1922-го ВЦИК издал декрет об изъятии церковных ценностей. Преображенский храм был очень богат. По церковной описи 1906 года, в нём имелось 51 кг серебряных украшений и почти 19 кг золотых. Все эти ценности были изъяты. Трёхъярусный позолоченный иконостас удалось сохранить (его закрасили краской), но со многих икон были сняты золотые и серебряные ризы.
В 30-е годы, в период самых жестоких гонений на церковь, её снова спасли прихожане. Когда они узнали, что храм пришли взрывать, вошли туда вместе с детьми и сказали: «Взрывайте! Но мы отсюда не выйдем!» Борцы с религией махнули рукой и на время оставили здание в покое.
В 1940 году снова активизировались гонения на церковь. В Обуховку наезжали комиссии, интересуясь у настоятеля отца Иоанна (Ковалевского), почему он не закрывает храм, когда в округе уже все давно не служат. А он отвечал, что не может этого сделать, потому что там постоянно находятся люди. Священник обещал закрыть церковь тотчас, как только люди из неё выйдут. Но прихожане ни на минуту не оставляли свой храм: они дежурили в нём посменно, ночуя прямо на полу.
А впереди была ещё война... И хотя бомбёжками было разрушено немало храмов, Преображенская церковь снова уцелела.
Когда немецкие разведчики зашли в Обуховку и забрались с биноклем на колокольню, чтобы оглядеть окрестности, священник переправился через Дон в Азов и сообщил в военный штаб, что на колокольне вражеская разведка. Военные открыли огонь по колокольне, но она устояла. Была разрушена только церковная ограда, а в храме выбиты стёкла. До сих пор на церковных стенах видны следы от пуль и снарядов. Настоятель отец Николай считает, что не стоит залечивать старые раны храма: пусть хранят память о его трудной судьбе.

А какая благодать внутри! Пояса орнамента, росписи (сцены из Библии, лики святых, выполненные в явно светском духе) напоминают Васнецова, Нестерова и даже местами Репина; множество икон различного времени, трёхъярусный иконостас, сияющий позолотой, старинная изящная люстра (свечи другой люстры – более богатой, но не старой, – во время служб, встав на стремянку, зажигает служитель – где ещё такое увидишь)...
Впрочем, чудо случалось не только в судьбе самого храма, но и в жизни его служителей. В 50-е годы в храме служил отец Николай Крюков, бывший военный лётчик. Во время войны его самолёт подбили. Тот загорелся и рухнул вниз. Шансов на спасение не было. В последний момент Владимир стал молиться и пообещал: «Если выживу, посвящу свою жизнь Богу». Он пришёл в себя в госпитале, в крайне тяжёлом состоянии... Сразу после войны лётчик подал в отставку и принял сан священника.