В южной части лавры, слева от надвратной церкви Рождества святого Иоанна Предтечи, рядом с Михеевской церковью, митрополичьими покоями, Троицким собором и примыкающей к нему Никоновской церковью, напротив Успенского собора.
Построена по велению царевичей Иоанна и Петра (будущий Пётр I) Алексеевичей.

Пёстрый, богато декорированный храм, расписанный разными цветами «в шахмат», один из лучших образцов московского барокко и одна из самых заметных построек на территории лавры.
Внутри храма находится резной позолоченный иконостас XVII века из разрушенного храма «Никола Большой Крест» в Москве. Собственный иконостас не сохранился.

Площадь трапезной платы свыше 500 квадратных метров. Это одно из самых больших помещений XVII века, перекрытых сводом без промежуточных опор. Палата была предназначена для торжественных приёмов и праздничных трапез. В середине XX века в ней проходили заседания Поместных и Архиерейских соборов Русской православной церкви.

Зимой в церкви совершают основные монастырские богослужения литургии в 5:30 и 9:30, всенощные в 17:00. Во время служб можно поклониться захороненным здесь мощам святых Филарета и Иннокентия.

С западной стороны (справа, если стоять лицом ко входу в храм) расположена Михеевская церковь, ещё правее примыкают Митрополичьи покои.

Если повернуться к входу в церковь спиной, напротив неё виден Успенский собор, левее него, напротив Михеевской церкви – храм Сошествия Святого Духа на апостолов, справа на некотором отдалении – надвратная церковь Рождества святого Иоанна Предтечи.